二代测序 简化NGS工作流程的工具

二代测序
简化NGS工作流程的工具

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简化NGS工作流程的工具二代测序                              简化NGS工作流程的工具

二代测序



二代测序(Next generation sequencing,简称NGS)是一种能同时完成几百万个DNA链测序工作的高通量测序途径。许多科研工作者将NGS用作一个从众多不同的细胞类型中获取详细且全面的基因组的基因修饰和表观遗传修饰的重要工具。选择本公司的综合试剂盒组合,提取并制备您用于NGS分析的文库样品。无论您需要制备的样品是用于基因芯片测序、全基因组测序还是亚硫酸氢盐测序,本公司的试剂盒都能实现更简易、高效、便捷的测序工作。

◆可靠和精简的NGS流程

二代测序                              简化NGS工作流程的工具

■ 核酸提取


● 快捷-在恒定且隔绝的条件下,全套流程可短至15分钟完成。

● 有效-用极少的原料(少至1ng)从多种类样品中高效率分离核酸

● 可靠-本公司为便捷地回收核酸专门设计的色谱柱

● 安全-使用无毒试剂,不含苯酚、氯仿


■ 文库制备

● 快捷和精简的流程-简单的清理步骤达到简洁、省时的流程,并且避免了操作失误和宝贵样品的损失。

● 极度便利-试剂盒包括了文库制备的每个步骤所需的成分,以达到可靠精准的结果

● 误差小-优质酶的应用使得高产量的核酸文库重现性好,并伴随极低的测序误差和错误率

● 灵活-核酸输入范围大,均可用于非条形码文库(单一)和条形码文库(多重)的制备


◆产品信息


■ 核酸提取

产品编号

产品名称

样品输入量

洗脱液体积

流程需时

ENZ-GEN500

AMPIXTRACT™ General Tissue Section DNA Isolation Kit

1 ng(最适范围10 ng-1 μg)

8-20 μL

2 h

ENZ-GEN501

AMPIXTRACT™ Paraffin Tissue Section DNA Isolation Kit

1 ng(最适范围10 ng-1 μg)

8-20 μL

2 h

ENZ-GEN502

AMPIXTRACT™ Urine DNA Isolation Kit

1 ng-2 μg(最适范围10 ng-1 μg)

8-20 μL

20 min

ENZ-GEN503

AMPIXTRACT™ Blood and Cultured Cell DNA Extraction Kit

1 ng-4 μg(最适范围10 ng-1 μg)

10-20μL

20 min

ENZ-45018

EPIXTRACT® DNA Isolation Kit for Plasma/Serum

0.1 ng(最适范围1 ng-1 μg)

8-20 μL

15 min

■ 文库制备

产品名称

产品编号

输入类型

输入范围(最适范围)

流程需时

DNA

AMPINEXT™ DNA Library Preparation Kit

ENZ-GEN504

DNA

5 ng-1 μg
(100 ng-200 ng)

<2.5 h

AMPINEXT™ High-Sensitivity DNA   Library Preparation Kit

ENZ-GEN505

DNA

0.2 ng-100 ng

(10 ng-50 ng)

<1.5 h

亚硫酸氢盐测序

AMPINEXT™ High-Sensitivity Bisulfite-Seq Kit

ENZ-GEN508

DNA

0.2 ng-200 ng
(10 ng-50 ng)

<6.5 h

AMPINEXT™ RNA Bisulfite-Seq   Kit 

ENZ-GEN510

RNA

5 ng-1 μg
(200 ng-500 ng)

6 h

AMPINEXT™ 5-mC RNA   Bisulfite-Seq Easy Kit 

ENZ-GEN511

RNA

5 ng-500 ng
(100 ng- 200 ng)

亚硫酸氢盐修饰后测序

AMPINEXT™ Post-Bisulfite DNA Library Preparation Kit

ENZ-GEN512

DNA

0.5 ng-1 μg
(100 ng-200 ng)

5 h

芯片测序

AMPINEXT™ CHIP-Seq High-Sensitivity Kit

ENZ-GEN509

细胞

105-106 个细胞
(4×105-5×105个细胞)

<7 h

组织

5 mg-50 mg
(20 mg-30 mg)

■ 相关产品

产品编号

产品名称

内含物

ENZ-GEN506

AMPINEXT™ DNA Size Selection Kit

MQ结合珠,洗脱液,96孔板

ENZ-GEN507

AMPINEXT™ NGS Barcode (Index) Set-12

AMPINEXT™ 条形码1-12(10 μM)

AMPINEXT™ 通用引物(10 μm)

※ 本页面产品仅供研究用,研究以外不可使用。

进出口操作流程

 

上海金畔生物科技有限公司进出口操作流程

一:进出口监管环境,基本流程和操作指南

1.科研涉及进出口材料的监管分类

2.出入境卫生检疫

3.出入境动植物检疫

4.进出口流程及操作指南

上海口岸出入境特殊物品概况      

2006年,上海生物产业还处于起步阶段,生物材料年进口量仅700余批,货值在1.1亿美元左右。       2016年上海进口生物材料批次就超过12000批、货值超过24亿美元,同比10年前增长20多倍。2016年,上海生物医药产业实现产值2721.2亿元,约占全国的60%。          

2018年上海口岸入出境特殊物品出入境特殊物品达到72771批次,同比增长22.2%,占全国53.3%。

上海口岸出入境特殊物品概况

2018年12月,上海海关开发的风险评估信息平台在全国口岸推广,在全国海关特殊物品风险评估流程和技术要点方面建立了统一标准,实现了评估无纸化、流程可视化、结果可预期,进一步提升了企业体验度和获得感。目前,风险评估由原先9个环节减少为5个,评估时长压缩四分之一。 同时,上海海关为诚信企业、国家重大科研项目开辟“绿色通道”,审批时间从20个工作日缩短至3-5个工作日。为服务自贸区发展,将D级特殊物品行政许可审批权限下放至属地机构,进一步实现特殊物品审批流程扁平化和办理化,加快了科研用特殊物品的通关速度。为支持上海加快建设具有影响力的科创中心战略部署,上海海关还设立了国内科创专门服务机构——上海科创中心海关,推动浦东机场货站和监管仓库功能延伸至张江园区,为生物医药产业提供空运进口货物通关、查验、提货“一站式”服务和冷冻冷藏、恒温等个性化服务。

 

 

 

1.科研涉及进出口材料的监管分类

化学试剂

特殊物品

动物源生物材料及制品

实验动物

药品

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

特殊物品分级

 

3.出入境动植物检疫    动植物检疫的监管和审批受理范围主要有动物源性生物材料及制品(动物血液、血浆、血清、组织、胚胎/遗传物质、动物疫苗、动物排泄物、动物病原体等)、实验动物(模式生物/实验动物)、动物遗传物质等

 

 

4.进出口流程及操作指南

 

4.进出口流程及操作指南-卫检流程

一、申请特殊物品出入境的申请人应为生产、使用和销售特殊物品的单位或个人,其中只有用于个人疾病预防、诊断和治疗的特殊物品,且数量再合理范围内的才能以个人名义申请。

二、上海地区特殊物品申请人可以申请对低风险特殊物品实施“一次审批,分次核销”,申请时在《出入境特殊物品卫生检疫审批申请表》备注中添加“申请分批核销”内容即可。低风险特殊物品定为用于科学研究的低风险类生物制品,以及已获得食品药品监督管理部门批准文件的,用于治疗、预防、诊断的生物制品、血液制品。

三、以保税形式进入综保区、保税库的特殊物品,由综保区及保税库所在地分支机构受理报检查验;以邮件、邮包形式出入境的特殊物品由邮检办受理报检查验;旅客携带的特殊物品在旅检口岸实施查验。

四、申请人每次提交申请表时应在“出入境口岸”处选择相应的分支机构,没有对应选项的,在申请表备注中特别说明。

4.进出口流程及操作指南-高风险

卫检流程——高风险产品风险评估(A&B级风险)

四、风险评估形式
       根据出入境特殊物品生物危害程度不同,风险评估分为文字材料审核、实验室检测和现场考核三种形式。
(一)文字材料审核
1.专家组应对评估材料进行审核,确定生物危害程度,判定与其生物安全控制能力是否相适应。
2.专家在完成文字材料审核后将审核意见反馈评估单位。
(二)实验室检测
1.确定检测机构。
检测机构应由申请单位提出具有相应资质的备选单位,并出具检测机构资质证明,由评估单位确认同意。
2.检测报告要求。
(1)检测特殊物品的名称(微生物需注明其中文学名及拉丁名)
(2)检测的依据、项目、方法、结果、过程的描述
(3)签发人签字,检测机构盖章,并注明日期
(三)风险评估流程
(1)启动风险评估程序。
(2)组织风险评估。
(3)受理风险评估材料。

4.进出口流程及操作指南-案例:低风险(C&D级风险)

审批(可多次核销)       口岸放行          按比例抽查

低风险(C&D级风险)制品是指不含任何病原微生物,不含任何毒素,不含人体组织、细胞、血液及其成分的人体外使用的生物制品。如用基因工程或人工合成技术生产的抗原、抗体、及其他蛋白质;所有经纯化的酶及其试剂;经纯化的DNA、RNA和其相关产品如质粒、引物、cDNA文库等

进口卫检低风险产品的审批办理流程

1.申请《入/出境特殊物品卫生检疫审批单》(3-5工作日)

2.货物运输(2-3日)

3.货物到港,凭《入/出境特殊物品卫生检疫审批单》报检,换取通关单,凭通关单报关,海关放行、检疫查验(2-3工作日)

4.货物派送至收件人,无需后续监管

4.进出口流程及操作指南-案例:高风险
(A&B级风险)

人的细胞、组织、胚胎、器官、人体标本、全血、血液有形成分、血清、排泄物、分泌物、附着物等。
病原微生物是指引发人类疾病的细菌、细菌毒素、病毒、真菌、立克次体、螺旋体、衣原体、支原体等。

1.申请风险评估(约每月一次,资料齐全20个工作日)

2.申请《入/出境特殊物品卫生检疫审批单》(3-5工作日)

3.货物运输(2-3日)

4.货物到港,凭《入/出境特殊物品卫生检疫审批单》报检,换取通关单,凭通关单报关,海关放行、检疫查验(2-3工作日)

5.货物派送至收件人,需后续监管

 

二:进出口的相关法律法规解读

 

 

进出口生物试剂/生物材料所涉及的主要政策法规

法规名称

文号

中华人民共和国国境卫生检疫法

主席令第83号(2007年修正)

中华人民共和国国境卫生检疫法实施细则

中华人民共和国国务院令 第574

出入境特殊物品卫生检疫管理规定

国家质检总局令第160号(2015年)

中华人民共和国进出境动植物检疫法

主席令第53号(1991年)

中华人民共和国进出境动植物检疫法实施条例

国务院令第206号(1997年)

关于做好进境动物源性生物材料及制品检验检疫工作的通知

国质检动函【2011】2

进境动植物检疫审批管理办法

国家质检总局第25号局令(2002年)

进境动物遗传物质检疫管理办法

国家质检总局第47号局令(2003年)

进出口环保用微生物菌剂环境安全管理办法

中华人民共和国环境保护部,国家质检总局 部令 第10号(2010

出入境人员携带物检疫管理办法

国家质检总局令第146号(2012年)

关于加强医用特殊物品出入境卫生检疫管理的通知

卫生部、国家质检总局卫科教发[2003]230号(废止)

可感染人类的高致病性病原微生物 菌(毒)种或样本运输管理规定

卫生部令第45号(2006年)

人类遗传资源管理暂行办法

国办法【1998】36号(1998年)

科技部关于进一步加强人类遗传资源管理工作的通知

国科发社【2013】615

出入境特殊物品卫生检疫管理规定

海关总署243号令

 

三、生物冷链运输

1.常见涉及生物医药冷链运输的产品的UN编号

2.UN2814/UN3373的发运

3.干冰UN1845的发运

UN2814的发运—包装

 

UN3373的发运—包装和唛头示意

 

干冰的发运—包装和唛头示意

 

如何规范的发运干冰样本
—-确保选择的航空公司在始发站和目的站均有资质操作样本
—-提前1天订舱
—-确保样本的非危/非传染性,并给航空公司提供航空公司认可的证明
—-正确地在货物上贴唛头/标签,并在主单上申报干冰净重

通常的标准:
通常用干冰运输试剂,就是手指甲大小的东西,24小时到达的,需要干冰数量也不得低于5kg;48小时到达的,干冰用量不得低于10公斤;夏季由于温度高,可以适当再增加干冰量(大约是平时的1.5倍)

运输途中保存的时间,比如可以装12公斤货物的箱子,放入了6公斤干冰和4公斤的药品或者其他物体,能保证一天左右的时间低温冷藏。如果保温箱够大,哪怕是50公斤的货,大概40公斤左右的干冰可以维持一周运输时间。