jenabioscience PP-101说明书

 

Jena Bioscience由德国马普所(MPI)的分子生理学家于1998年共同创办的生物公司,致力为的科研院所、医院、制药企业以及诊断试剂盒生产企业提供各类试剂。在结构学研究方面全面提供晶体筛选试剂盒、优化试剂、工具和各类耗材等。

jenabioscience PP-101说明书

JBS dNTP-Mutagenesis Kit

JBS dNTP诱变试剂盒

dNTP类似物的随机诱变

 

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PP-101 15反应 260,16 添加到购物篮/报价添加到记事本

图1:dPTP和8-Oxo-dGTP的结构

图2:诱变速率与PCR循环数的关系[Zaccolo 等。]

仅用于体外

运输:在蓝色冰上运输

储存条件:在-20°C下储存,
避免冷冻/融化循环,强烈建议在使用前等分修饰核苷酸

保质期: 12个月

描述:
JBS诱变系列
在三十亿年的进化过程中,自然界通过反复反复的随机诱变循环,然后通过体内选择编码蛋白的功能,自然产生了过多的蛋白。在过去的二十年中,这个自然进化的例子指导研究人员开发了蛋白质体外排列的策略。
在应用的各种策略中,出现了三种主要的强大技术。

dNTP类似物的随机诱变
此方法基于通过PCR将诱变的dNTP类似物(例如8-oxo-dGTP和dPTP)掺入扩增的DNA片段中。仅在四种天然dNTP的存在下,通过第二个PCR步骤消除了诱变dNTP,致突变率高达20%。
→ JBS dNTP诱变试剂盒#PP-101

由Caldwell&Joyce(1992)开发的Error-Prone PCR进行随机诱变该方法在引起DNA聚合酶错误率增加的条件下,利用PCR反应在目的基因中引入了突变。易错PCR的诱变率在0.6-2.0%的范围内。
→ JBS Error-Prone套件#PP-102

通过DNA
改组进行随机诱变 Stemmer(1994)开发的DNA改组通过随机分裂一个基因或一组相关基因来生成文库,然后在自引发PCR反应中重组片段。该方法允许重组来自不同相关基因的序列。诱变的总速率约为。0.7%。
→ JBS DNA改组试剂盒#PP-103

Jena Bioscience现在在单独的套件中提供了每种“即用型”技术所需的所有必要组件,并附有精简的文档,可很大程度地提高成功率。

含量:
Taq聚合酶(红色帽)
5单位/微升,40微升

诱变缓冲液(绿帽)
10x浓度,200μl

dNTP混合液(白色帽)
每个10 mM dNTP(dATP,dCTP,dGTP,dTTP),100μl

dPTP(黄色瓶盖)
10 mM,40μl

8-oxo-dGTP(蓝帽)
10 mM,40μl

PCR级水(白色瓶盖)
2x 1毫升

dNTP类似物
8-oxo-dGTP和dPTP的随机诱变是诱变的dNTP类似物,可使用Taq聚合酶通过PCR将其掺入DNA [Zaccolo 等。,Zang 等。]。
将8-Oxo-dGTP掺入模板腺嘌呤对面,产生两个过渡突变:A→C:T→G。诱变的总速率约为 据报道有2%(图2),其中A→C:T→G的比率约为1。1:1.5。

据报道,dNTP模拟物dPTP约为。诱变作用是8-oxo-dGTP的10倍(图2)。dPTP诱导的突变以大约5:4:1:1的比率发生(A→G:T→C:G→A:C→T),总诱变率高达19%。
由8-Oxo-dGTP和/或dPTP诱导的随机诱变在两步PCR过程中进行。首先,在四种天然dNTP加诱变类似物dPTP和/或8-Oxo-dGTP的存在下扩增目标DNA片段。诱变速率可以通过PCR循环数轻松控制(图2)。

然后,在不存在诱变类似物的情况下,将首轮PCR的产物进行第二轮PCR。该步骤在克隆和转化之前从靶DNA中消除了非天然类似物。

推荐的测定准备

  • 对于50μl反应,请在无菌小瓶中加入5μl10x诱变缓冲液
  • 添加多25 fmol模板DNA和0.2-1μM合适的引物
  • 加入2.5μldNTP混合物
  • 加入2.5μl每个诱变类似物
  • 加入1μl(5 u)Taq聚合酶
  • 加入PCR级水至终体积为50μl

推荐的热循环条件

变性 92°摄氏度 1分钟
退火 55°摄氏度 1.5分
延期 72°摄氏度 5分钟

循环数:5-30(请参见图2)
。诱变的速率主要取决于循环数(图2),并且可以通过诱变dNTP的数量进行微调[Zaccolo 等。]。

 

终PCR
为了消除诱变性dNTP,在第二步PCR中使用等分的1μlPCR反应作为模板。取10x诱变缓冲液,并按上述相同浓度添加模板,引物,dNTP Mix和Taq聚合酶。装满PCR级水至50μl。
使用相同的热循环条件,但20-30个循环。

精选参考文献:
Zang 等。(2006)而高保真度的dCTP与7,8-dihydro-8-oxodeoxyguanosine相对,通过sololotarius DNA聚合酶Dpo4。Journal of Biological Chemistry281:2358。
Zaccolo 等。(1999)高频随机诱变对体外蛋白质进化的影响:TEM-1β-内酰胺酶的研究。J.摩尔 生物学 285(2):775。
Crameri 等。(1998)DNA改组从不同种类的基因家庭加速定向进化。自然 391:288。
Zaccolo 等。(1996)一种使用核苷类似物的三磷酸酯衍生物的混合物随机诱变DNA的方法。J.摩尔 生物学 255:589。
Stemmer(1994)通过DNA改组在体外快速进化蛋白质。自然 370:389。
Cadwell 等。(1992)通过PCR诱变使基因随机化。PCR方法。应用 2:28。

 

 

 

 

Fast Pfu DNA 聚合酶


Fast Pfu DNA 聚合酶

简要描述:Fast Pfu DNA 聚合酶

详细介绍

产品咨询

目录号 规格 备注 价格 说明书下载
E031-01A 250U 含dNTP 360元
E031-01B A包装×5 含dNTP 1620元
E031-02A 250U 不含dNTP  310元
E031-02B A包装×5 不含dNTP  1395元

 

· 制品内容 (250 U)

Fast Pfu DNA聚合酶(5 U/μl) 50 μl
dNTP 混合液 (各10 mM) 250 μl
5 × Fast Pfu Buffer with Mg2+ 2000 μl

 

· 制品说明
Pfu DNA聚合酶为zui常用的高保真DNA聚合酶,在需高保真的PCR反应中广范使用,然而Pfu酶扩增灵敏度不高,延伸速度缓慢(0.5kb/分钟)给众多的使用者带来了不便。针对普通Pfu酶的以上缺点,SinoBio采用分子进化技术对普通Pfu酶进行改造,制备的新型聚合酶Fast Pfu酶具有快速、高灵敏度、抗干扰能力强等特点,是新一代的高保真DNA聚合酶。使用Fast Pfu能获得更理想的扩增结果,并大幅度缩短扩增反应时间。

· 用 途
用于要求保真度比较高的PCR反应,包括克隆PCR、DNA片段拼接、引入突变、全基因合成等(参见 SinoBio 实验方案)。

· 产品特点
高保真:具有同Pfu酶相同的保真度,为普通Taq酶的10倍。
快速:Fast Pfu扩增速度为普通Pfu酶的数倍,72℃保温30秒可延伸1kb以上。
高效:以λDNA为模板,扩增长度可达12kb,能高效扩增≤6kb片段;对于人基因组DNA等复杂模板,能有效扩增出3kb特定基因片段。
*配方的5×Buffer:使PCR扩增反应更加稳定、灵敏、高效。

· 质量保证
经多次柱纯化,SDS-PAGE胶检测仅可见清晰单一的目的条带;PCR方法检测无大肠杆菌DNA残留,无核酸内、外切酶污染。

· 使用建议

Fast Pfu DNA聚合酶产生的PCR产物为平滑末端,无3’端”A”突出, 其PCR产物的克隆有两种方案:
1.PCR前引物进行5’端加磷修饰或将PCR产物磷酸化处理后再直接克隆于平滑末端的载体中(参见 Sinobio 实验方案)。
2.将产物3’末端加A后再与T-Vector连接(参见 SinoBio 实验方案)。

*由于Fast Pfu DNA聚合酶的校对活性可引起引物从3′端被部分降解。因此在设计引物时应适当增加引物的长度,理想的引物长度为 20-30碱基。另外为了减少由3′-5′外切酶活性引起的引物降解, 尽量在冰上配置反应体系,并zui后加入Fast Pfu酶。。

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· 其他说明

 

Taq Plus DNA聚合酶


Taq Plus DNA聚合酶

简要描述:Taq Plus DNA聚合酶

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Taq Plus DNA聚合酶
  
  

目录号 规格 备注 价格 说明书下载
E002-01A 250U 含dNTP 230元
E002-01B A包装×5 含dNTP 1035元
E002-02A 250U 不含dNTP  180元
E002-02B A包装×5 不含dNTP  810元
 

· 内容 (250 U)

(5 U/μl) 50 μl
dNTP 混合液 (各10 mM) 200 μl
5 × Taq Plus Buffer with Mg2+ 2000 μl

 

· 说明 
使用本制品扩增得到的PCR产物具有3’端”A”突出,可直接克隆于T-Vector中。

· 相关图片 
 是Taq DNA聚合酶和Pfu DNA聚合酶按特定比例混合而成。具有Taq DNA聚合酶很强的DNA聚合能力,同时由于Pfu DNA聚合酶的存在,具有一定的保真特性, 能部分纠正DNA扩增过程中所出现的错误。与Taq DNA聚合酶相比,具有扩增长度增加(简单模板可有效扩增20kb,复杂模板可有效扩增10kb), 保真度好的特点;与Pfu DNA聚合酶相比,具有扩增速度快,反应效率高的优势。使用本制品扩增得到的PCR产物具有3’端”A”突出,因此可直接克隆于T-Vector中。

· 用 途
1)可替代大部分Taq DNA聚合酶的用途;
2)需高灵敏度的PCR扩增;
3)大片段PCR扩增反应(可达20 kb);

· 特点
更高效:以DNA为模板,扩增长度可达20kb。
更灵敏:比Taq酶扩增灵敏度更高(图例一)。

· 质量保证
经多次柱纯化,SDS-PAGE胶检测仅可见清晰单一的目的条带;
PCR方法检测无大肠杆菌DNA残留,无核酸内、外切酶污染。

· 使用建议
使用本制品扩增得到的PCR产物具有3’端”A”突出,可直接克隆于T-Vector中。

 

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